FastQCFastQC Report
Thu 5 Jun 2025
ERR11213604.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameERR11213604.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences17755
Total Bases26.2 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length1096-5062
%GC51

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCC2701.520698394818361No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAATTTTACCTTAGATAGC1570.8842579555054915No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTATCGACTTTACCCTAGGCCGC1480.833568009011546No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAATTTTACCTTAGATAGC1310.7378203323007603No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTATCGACTTTACCCTAGGCCGC1040.5857504928189243No Hit
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AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATG280.15770205575894114No Hit
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AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATG270.15206983948183608No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAATACATG250.14080540692762603No Hit
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AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACTAGTTTTACCCTAGGCAGC240.13517319065052097No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTATTGGTCTAACCCTAGGCGAC240.13517319065052097No Hit
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AGGGTTCGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAATACATG230.12954097437341594No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACCGACCCCACCTTCGACGGC220.12390875809631091No Hit
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AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGTAGGCTTAACACATG210.11827654181920585No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGTAGGCTTAACACATG210.11827654181920585No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAACC210.11827654181920585No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTTACCCCAGTCATGAAGCACACCGTGGTAAAC200.11264432554210081No Hit
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