FastQCFastQC Report
Thu 5 Jun 2025
ERR11213607.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameERR11213607.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences34182
Total Bases50.2 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length148-4583
%GC51

[OK]Per base sequence quality

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[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCACCAACCCTGCCTTCGGCATC370.10824410508454743No Hit
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AGAGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATG360.105318588730911No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGTAGGCTTAACACATG360.105318588730911No Hit
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