FastQCFastQC Report
Thu 5 Jun 2025
ERR11213610.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameERR11213610.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences44219
Total Bases64.6 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length70-4640
%GC50

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT657214.862389470589566No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT38708.751893982224836No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT22054.986544245686243No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG14563.2927022320721857No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT11972.7069811619439608No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG11162.523801985571813No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG10062.27504014111581No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG9722.1981501164657726No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG9602.171012460706936No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGCCCCACCTTCGACGTC7931.7933467513964585No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG7841.7729935095773313No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG7431.680273185734639No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG7111.6079061037110745No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG6821.542323435627219No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG6741.524231665121328No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG5351.2098871525814694No Hit
GGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC4771.0787218164137589No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG4631.0470612180284493No Hit
AGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC4501.0176620909563763No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGCCCCACCTTCGACGTC4431.0018317917637214No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG4300.9724326646916484No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG4250.9611253081254665No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG4180.9452950089328118No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGCCCCACCTTCGACGTC3120.7055790497297542No Hit
AGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC2750.6219046111400077No Hit
GTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCTC2690.6083357832605893No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG2670.6038128406341166No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCTC2010.45455573396051474No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1770.4002804224428413No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGCCCCACCTTCGACGTC1710.38671159456342297No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCGGC1540.3482665822384043No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCT1380.31208304122662206No Hit
AGGGTTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT1310.29625274203396734No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1310.29625274203396734No Hit
AGGGTTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT1310.29625274203396734No Hit
GCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCTC1260.2849453854677853No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1230.2781609715280762No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1200.271376557588367No Hit
AGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC1150.260069201022185No Hit
AGAGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT1150.260069201022185No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1140.25780772970894866No Hit
AGGGTTTGATTCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT1130.2555462583957122No Hit
AGGGTTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT1070.24197743051629392No Hit
AGAGTTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT1060.2397159592030575No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCGGC1010.22840860263687557No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCATCCCAGTTACCAGCCTCACCTTAGGATAC960.21710124607069362No Hit
AGGTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT960.21710124607069362No Hit
AGAGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT920.20805536081774803No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG920.20805536081774803No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG900.20353241819127524No Hit
GGTCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC880.19900947556480247No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG880.19900947556480247No Hit
AGAGTTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT870.19674800425156608No Hit
AGAGTTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT860.19448653293832968No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG850.19222506162509329No Hit
AGAGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT850.19222506162509329No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG840.1899635903118569No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG830.1877021189986205No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG820.18544064768538412No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG810.18317917637214773No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTGAGC810.18317917637214773No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAACTTTACCCTAGGCCGC800.18091770505891133No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG790.17865623374567494No Hit
AGAGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT790.17865623374567494No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCC770.17413329111920214No Hit
AGTCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC770.17413329111920214No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCT760.17187181980596575No Hit
AGAGTTTGATTCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT750.16961034849272938No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCATCCCAGTTACCAGCCTCACCTTAGGATCC740.16734887717949298No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG720.1628259345530202No Hit
AGGGTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC720.1628259345530202No Hit
AGGGTTTGATTCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT710.16056446323978382No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG680.15378004930007463No Hit
AGGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT650.14699563536036545No Hit
AGGGTTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT650.14699563536036545No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCGGC640.14473416404712905No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCACCAGCCCCACCTTCGACAGC630.14247269273389265No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCAGC630.14247269273389265No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCATCCCAGTTACCAGCCTCACCTTAGGATAC620.14021122142065628No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG610.1379497501074199No Hit
AGGGTTCGATCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC580.13116533616771073No Hit
GTCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT570.12890386485447433No Hit
AGAGTTTGATTCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT570.12890386485447433No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG560.12664239354123794No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG560.12664239354123794No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCATCCCAGTTACCAGCCTCACCTTAGGATCC560.12664239354123794No Hit
AGGGTTCGATTCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT550.12438092222800154No Hit
AGGGTTTGATCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC550.12438092222800154No Hit
AGGGTTCGATTCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT530.11985797960152875No Hit
AGGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCG530.11985797960152875No Hit
AGAGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT520.11759650828829235No Hit
AGGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT520.11759650828829235No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG510.11533503697505597No Hit
GAGTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC500.11307356566181957No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCT500.11307356566181957No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG500.11307356566181957No Hit
AGAGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT500.11307356566181957No Hit
AGGGTTTCGATTCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACA490.1108120943485832No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTATCGACTTTACCCTAGGCCGC490.1108120943485832No Hit
AGAGTTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT480.10855062303534681No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG480.10855062303534681No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG460.10402768040887402No Hit
AGGGTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATGC450.10176620909563762No Hit

[OK]Adapter Content

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