FastQCFastQC Report
Thu 5 Jun 2025
ERR11213614.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameERR11213614.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences42698
Total Bases62.7 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length559-3260
%GC50

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT38529.021499836057895No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT21805.105625556232142No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT18434.31636142208066No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT10442.4450793948194294No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG9912.320951801021125No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG7901.8502037566162348No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGCCCCACCTTCGACGTC6981.634736990022952No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG6651.5574499976579699No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG6101.4286383437163332No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG6101.4286383437163332No Hit
AGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC4951.1593048854747297No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG4841.1335425546864022No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG4641.0867019532530797No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG4431.0375193217480914No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG4180.9789685699564383No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGCCCCACCTTCGACGTC4040.9461801489531126No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG3840.8993395475197902No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCGGC3450.8080003747248115No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG3430.8033163145814792No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGCCCCACCTTCGACGTC3010.7049510515715022No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG2860.6698206004965104No Hit
AGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC2830.6627945102815119No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG2710.6346901494215186No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG2670.6253220291348541No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG2570.6019017284181929No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCAGC2460.5761393976298655No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG2430.5691133074148672No Hit
GGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC2390.5597451871282028No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCATCCCAGTTACCAGCCTCACCTTAGGATAC2380.5574031570565365No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCC2160.505878495479882No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCGGC2060.48245819476322077No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG1930.4520118038315612No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGCCCCACCTTCGACGTC1920.4496697737598951No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG1850.43327556325823224No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG1840.4309335331865661No Hit
GTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCTC1830.42859150311489996No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1790.4192233828282355No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG1710.40048714225490656No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACATG1700.3981451121832404No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACTATACCGTGGTCAAG1550.3630146611082486No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCGGC1470.3442784205349197No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCC1440.3372523303199213No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1430.3349103002482552No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCT1380.32320014988992457No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCATCCCAGTTACCAGCCTCACCTTAGGATAC1370.32085811981825846No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG1330.311489999531594No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCAGC1320.30914796945992784No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1280.2997798491732634No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG1240.29041172888659894No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCATCCAAATTATCAATCTCTCAATGGATTTT1140.2669914281699377No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG1140.2669914281699377No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1120.2623073680266054No Hit
AGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC1080.252939247739941No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCAGC1080.252939247739941No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACTAGTTTTACCCTAGGCGGC1070.25059721766827486No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCACCAGCCCCACCTTCGACAGC1070.25059721766827486No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1050.2459131575249426No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG1040.24357112745327653No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACTATACCGTGGTCAAG1030.24122909738161039No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1010.23654503723827816No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTTACCCCAGTCATGAAGCACACCGTGGTAAAC970.22717691695161366No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTGAGC940.22015082673661532No Hit
AGGTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCT940.22015082673661532No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCCGC930.21780879666494918No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACTAGTTTTACCCTAGGCAGC930.21780879666494918No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG920.21546676659328304No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAACTTTACCCTAGGCCGC900.2107827064499508No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG850.1990725560916202No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACTAGTTTTACCCTAGGCGGC850.1990725560916202No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCGGC840.1967305260199541No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGGATAAGACATG830.19438849594828797No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG830.19438849594828797No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCC820.19204646587662186No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCATCCCAGTTACCAGCCTCACCTTAGGATAC820.19204646587662186No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG790.1850203756616235No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTATCGACTTTACCCTAGGCCGC780.18267834558995738No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG770.18033631551829127No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG770.18033631551829127No Hit
GCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCTC760.17799428544662513No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG760.17799428544662513No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGCCGGC760.17799428544662513No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG750.17565225537495902No Hit
AGAGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT750.17565225537495902No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG750.17565225537495902No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG740.17331022530329288No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAACTTTACCCTAGGCCGC710.16628413508829454No Hit
AGGGTTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT710.16628413508829454No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG690.16160007494496229No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACTATACCGTGGTCAAG690.16160007494496229No Hit
AGGGTTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT670.15691601480163006No Hit
AGGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCG670.15691601480163006No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCCGC660.15457398472996392No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG650.1522319546582978No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGCTC650.1522319546582978No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCT620.14520586444329947No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTGAGC610.14286383437163333No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATG590.13817977422830108No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCACCAGCCCCACCTTCGACAGC590.13817977422830108No Hit
AGAGTTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT590.13817977422830108No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACTAGTTTTACCCTAGGCAGC580.13583774415663497No Hit
AGAGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT580.13583774415663497No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCC580.13583774415663497No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACTCCGTGGTGACC580.13583774415663497No Hit
AGAGTTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT570.13349571408496885No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCATCCCAGTTACCAGCCTCACCTTAGGATCC560.1311536840133027No Hit
AGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGCCCCACCTTCGACGT560.1311536840133027No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCATCCCAGTTACCAGCCTCACCTTAGGATAC560.1311536840133027No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG560.1311536840133027No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCAGC560.1311536840133027No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCATCCAAATTATCAATCTCTCAATGGATTTT550.1288116539416366No Hit
AGGGTTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT550.1288116539416366No Hit
AGGGTTTGATTCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT540.1264696238699705No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG530.12412759379830438No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGGATAAGACATG530.12412759379830438No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACTAGTTTTACCCTAGGCGGC530.12412759379830438No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG520.12178556372663826No Hit
GGTCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC520.12178556372663826No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCCGC520.12178556372663826No Hit
AGGGTTTGATTCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT510.11944353365497212No Hit
AGAGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT510.11944353365497212No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGAACGTACGCTGGCGGCACGCCTAACACATG500.11710150358330601No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGGATAAGACATG490.11475947351163988No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACTAATTTTACCCTAGGCCGC490.11475947351163988No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTTACCCCAGTCATGAAGCACACCGTGGTAAAC490.11475947351163988No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCACCAGCCCCACCTTCGACAGC490.11475947351163988No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTTACCCCAGTCATGAAGCACACCGTGGTAAAC480.11241744343997377No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATCCTACCGTGGCCGCT480.11241744343997377No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG480.11241744343997377No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACTAGTTTTACCCTAGGCGGC480.11241744343997377No Hit
AGTCTACCTTGTTACGACTTCACCCTAGTTACTGGCTCTACCTTAAGCGC470.11007541336830766No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGGATAAGACATG470.11007541336830766No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG470.11007541336830766No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG460.10773338329664152No Hit
AGAGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT450.1053913532249754No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG450.1053913532249754No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCTTAACACATG440.1030493231533093No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGTCCCAATTGCAGAGTTCATCTTCGGCGCC440.1030493231533093No Hit
AGAGTTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGTATGCTTAACACAT440.1030493231533093No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAACTTTACCCTAGGCCGC440.1030493231533093No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTATCGACTTTACCCTAGGCCGC440.1030493231533093No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAACC430.10070729308164317No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGGATAAGACATG430.10070729308164317No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCTAGTTACCAGTTTTACCCTAGGCAGC430.10070729308164317No Hit

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