| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (23229 cycles) |
| mean length before filtering: | 3732bp |
| mean length after filtering: | 3551bp |
| duplication rate: | 0.040366% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGA ->I5_Nextera_Transposase_1 | >Trans1_rc | >I5_Nextera_Transposase_1 | >Trans1_rc |
| total reads: | 138.731000 K |
| total bases: | 517.823573 M |
| Q20 bases: | 515.240764 M (99.501218%) |
| Q30 bases: | 511.496720 M (98.778184%) |
| Q40 bases: | 504.599797 M (97.446278%) |
| GC content: | 43.838005% |
| total reads: | 136.872000 K |
| total bases: | 486.153408 M |
| Q20 bases: | 485.467299 M (99.858870%) |
| Q30 bases: | 484.395323 M (99.638368%) |
| Q40 bases: | 482.260425 M (99.199227%) |
| GC content: | 43.844569% |
| reads passed filters: | 136.872000 K (98.659997%) |
| reads with low quality: | 1 (0.000721%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 1.858000 K (1.339282%) |
| Sequence | Occurrences |
| CTGTC | 112 |
| CTGTCT | 60 |
| CTGTATCT | 9 |
| CTGTCTCTT | 13 |
| CTGTCTCTTATACAC | 20 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGA | 18 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGAC | 32 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCG | 29 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAG | 36 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGAGGTAGG | 15 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGAGGTAGGTGG | 12 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGTCTACTGAGGTGT | 8 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGAGGTAGGTGGTGTAGA | 10 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGAGGTAGGTGGTGTAGATC | 34 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGAGGTAGGTGGTGTAGATCT | 8 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGAGGTAGGTGGTGTAGATCTCGGTGGTCGCCGTATCATT | 29 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAGTCTACTGAGGTGTAGATCTCGGTGGTCGCCGTATCATT | 18 |
| other adapter sequences | 285 |
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Value of each position will be shown on mouse over.
|
Value of each position will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
|
Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||