| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (23366 cycles) |
| mean length before filtering: | 4431bp |
| mean length after filtering: | 4125bp |
| duplication rate: | 0.177413% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGAC ->I7_Nextera_Transposase_1 | >Trans2_rc | >I7_Nextera_Transposase_1 | >Trans2_rc |
| total reads: | 116.113000 K |
| total bases: | 514.498059 M |
| Q20 bases: | 510.698345 M (99.261472%) |
| Q30 bases: | 505.507292 M (98.252517%) |
| Q40 bases: | 496.147992 M (96.433404%) |
| GC content: | 46.753426% |
| total reads: | 114.009000 K |
| total bases: | 470.369582 M |
| Q20 bases: | 469.372849 M (99.788096%) |
| Q30 bases: | 467.941829 M (99.483863%) |
| Q40 bases: | 465.207607 M (98.902570%) |
| GC content: | 46.710222% |
| reads passed filters: | 114.009000 K (98.187972%) |
| reads with low quality: | 2 (0.001722%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 2.102000 K (1.810305%) |
| Sequence | Occurrences |
| CTGTC | 78 |
| CTGTCT | 42 |
| CTGTCTC | 9 |
| CTGTATCT | 8 |
| CTGTCTCT | 9 |
| CTGTCTCTT | 16 |
| CTGTCTCTTATACAC | 11 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGA | 12 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACG | 27 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGA | 10 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGAACCAAGGA | 15 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGAACCAAGGATC | 29 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGCCAACATGATC | 10 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGAACCAAGGATCT | 10 |
| other adapter sequences | 284 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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