| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (15315 cycles) |
| mean length before filtering: | 2813bp |
| mean length after filtering: | 2688bp |
| duplication rate: | 0.001884% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG ->Trans2 |
| total reads: | 53.074000 K |
| total bases: | 149.317068 M |
| Q20 bases: | 148.501128 M (99.453552%) |
| Q30 bases: | 147.430731 M (98.736690%) |
| Q40 bases: | 145.563697 M (97.486308%) |
| GC content: | 43.032436% |
| total reads: | 52.147000 K |
| total bases: | 140.221602 M |
| Q20 bases: | 139.974154 M (99.823531%) |
| Q30 bases: | 139.640938 M (99.585895%) |
| Q40 bases: | 139.030656 M (99.150669%) |
| GC content: | 43.026138% |
| reads passed filters: | 52.147000 K (98.253382%) |
| reads with low quality: | 3 (0.005652%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 924 (1.740965%) |
| Sequence | Occurrences |
| GTCTC | 7 |
| GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAG | 7 |
| other adapter sequences | 377 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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