| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (30034 cycles) |
| mean length before filtering: | 3477bp |
| mean length after filtering: | 3281bp |
| duplication rate: | 0.065363% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGAC ->I7_Nextera_Transposase_1 | >Trans2_rc | >I7_Nextera_Transposase_1 | >Trans2_rc |
| total reads: | 367.179000 K |
| total bases: | 1.276749 G |
| Q20 bases: | 1.268459 G (99.350670%) |
| Q30 bases: | 1.257526 G (98.494387%) |
| Q40 bases: | 1.238318 G (96.989869%) |
| GC content: | 42.166192% |
| total reads: | 361.900000 K |
| total bases: | 1.187460 G |
| Q20 bases: | 1.185168 G (99.807002%) |
| Q30 bases: | 1.182026 G (99.542421%) |
| Q40 bases: | 1.176215 G (99.053044%) |
| GC content: | 42.172027% |
| reads passed filters: | 361.900000 K (98.562282%) |
| reads with low quality: | 11 (0.002996%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 5.268000 K (1.434723%) |
| Sequence | Occurrences |
| CTGTC | 227 |
| CTGTCT | 90 |
| CTGTCTCTT | 153 |
| CTGTCTCTTATACAC | 40 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACG | 98 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACC | 42 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACATTGCACCTTA | 68 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACATTGCACCTTATC | 372 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACCAGAACGCGAATC | 69 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACATTGCACCTTATCT | 173 |
| other adapter sequences | 1510 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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