| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (53237 cycles) |
| mean length before filtering: | 6298bp |
| mean length after filtering: | 5529bp |
| duplication rate: | 1.013334% (may be overestimated since this is SE data) |
| total reads: | 1.606085 M |
| total bases: | 10.116038 G |
| Q20 bases: | 10.003900 G (98.891482%) |
| Q30 bases: | 9.848274 G (97.353079%) |
| Q40 bases: | 9.566335 G (94.566028%) |
| GC content: | 45.806337% |
| total reads: | 1.555941 M |
| total bases: | 8.602994 G |
| Q20 bases: | 8.578501 G (99.715301%) |
| Q30 bases: | 8.542343 G (99.295000%) |
| Q40 bases: | 8.471855 G (98.475661%) |
| GC content: | 45.744030% |
| reads passed filters: | 1.555941 M (96.877874%) |
| reads with low quality: | 144 (0.008966%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 50.000000 K (3.113160%) |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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