| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (24985 cycles) |
| mean length before filtering: | 2626bp |
| mean length after filtering: | 2458bp |
| duplication rate: | 0.014553% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG ->Trans2 |
| total reads: | 151.172000 K |
| total bases: | 397.109870 M |
| Q20 bases: | 394.798999 M (99.418078%) |
| Q30 bases: | 391.672447 M (98.630751%) |
| Q40 bases: | 386.200567 M (97.252825%) |
| GC content: | 56.652103% |
| total reads: | 148.665000 K |
| total bases: | 365.503158 M |
| Q20 bases: | 364.811052 M (99.810643%) |
| Q30 bases: | 363.833059 M (99.543069%) |
| Q40 bases: | 362.030930 M (99.050014%) |
| GC content: | 56.795994% |
| reads passed filters: | 148.665000 K (98.341624%) |
| reads with low quality: | 6 (0.003969%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 2.501000 K (1.654407%) |
| Sequence | Occurrences |
| GTCTC | 59 |
| GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAG | 45 |
| other adapter sequences | 3472 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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