| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (27551 cycles) |
| mean length before filtering: | 3922bp |
| mean length after filtering: | 3671bp |
| duplication rate: | 0.037382% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG ->Trans2 |
| total reads: | 382.541000 K |
| total bases: | 1.500573 G |
| Q20 bases: | 1.490000 G (99.295410%) |
| Q30 bases: | 1.475732 G (98.344615%) |
| Q40 bases: | 1.450589 G (96.668992%) |
| GC content: | 47.410736% |
| total reads: | 374.473000 K |
| total bases: | 1.374868 G |
| Q20 bases: | 1.372060 G (99.795823%) |
| Q30 bases: | 1.368081 G (99.506367%) |
| Q40 bases: | 1.360599 G (98.962215%) |
| GC content: | 47.415459% |
| reads passed filters: | 374.473000 K (97.890945%) |
| reads with low quality: | 12 (0.003137%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 8.056000 K (2.105918%) |
| Sequence | Occurrences |
| GTCTC | 161 |
| GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAG | 109 |
| other adapter sequences | 3076 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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