| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (23972 cycles) |
| mean length before filtering: | 3465bp |
| mean length after filtering: | 3275bp |
| duplication rate: | 0.485207% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAG ->Trans2 |
| total reads: | 65.539000 K |
| total bases: | 227.093805 M |
| Q20 bases: | 225.821340 M (99.439674%) |
| Q30 bases: | 224.036484 M (98.653719%) |
| Q40 bases: | 220.813318 M (97.234408%) |
| GC content: | 43.461268% |
| total reads: | 64.117000 K |
| total bases: | 210.045685 M |
| Q20 bases: | 209.721221 M (99.845527%) |
| Q30 bases: | 209.234804 M (99.613950%) |
| Q40 bases: | 208.288925 M (99.163630%) |
| GC content: | 43.438616% |
| reads passed filters: | 64.117000 K (97.830300%) |
| reads with low quality: | 0 (0.000000%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 1.422000 K (2.169700%) |
| Sequence | Occurrences |
| GTCTC | 18 |
| GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAG | 10 |
| GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACA | 22 |
| other adapter sequences | 909 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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