| fastp version: | 1.0.1 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | single end (27175 cycles) |
| mean length before filtering: | 3699bp |
| mean length after filtering: | 3497bp |
| duplication rate: | 0.870538% (may be overestimated since this is SE data) |
| Detected read1 adapter: | CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGAC ->I7_Nextera_Transposase_1 | >Trans2_rc | >I7_Nextera_Transposase_1 | >Trans2_rc |
| total reads: | 637.537000 K |
| total bases: | 2.358279 G |
| Q20 bases: | 2.344722 G (99.425152%) |
| Q30 bases: | 2.325595 G (98.614097%) |
| Q40 bases: | 2.291127 G (97.152496%) |
| GC content: | 43.114514% |
| total reads: | 629.951000 K |
| total bases: | 2.203210 G |
| Q20 bases: | 2.199887 G (99.849199%) |
| Q30 bases: | 2.194847 G (99.620422%) |
| Q40 bases: | 2.184977 G (99.172428%) |
| GC content: | 43.104946% |
| reads passed filters: | 629.951000 K (98.810108%) |
| reads with low quality: | 7 (0.001098%) |
| reads with too many N: | 0 (0.000000%) |
| reads too short: | 7.579000 K (1.188794%) |
| Sequence | Occurrences |
| CTGTC | 385 |
| CTGTCT | 163 |
| CTGTCTCTT | 59 |
| CTGTCTCTTATACAC | 392 |
| CTGTCTCTTATACACATCTGA | 68 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACG | 119 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGAC | 909 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGCATGAGTTA | 83 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGCATGAGTTATC | 310 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGCATGAGTTATCT | 120 |
| CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTGCATGAGTTATCTCGTATGC | 183 |
| other adapter sequences | 2723 |
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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